就學貸款申請辦法原本規定學生要在畢業、退伍1年後開始還款，但因社會不景氣，不少申貸者畢業即失業，或薪水太低，工作1年後還款仍有問題，因此教育部修正貸款辦法，給弱勢學生還款緩衝時間，還款前1年平均月收入不到2萬元及低收入戶者，最多可申請延緩還款3年，緩延時間利息仍由政府代付。教育部同時放寬成績優異、取得國外學校獎學金的清寒學生，可以專案的方式申請緩繳，等到留學結束才開始還款，以利專心深造。
此外，以往規定，每學期申請就學貸款都要攜帶戶籍謄本，導致寒暑假辦理申貸時，戶政事務所都擠滿申請戶籍謄本的學生。為簡化程序，即日起，同一教育階段只須在第1次申請就學貸款時，才需檢附戶籍謄本。